Произходът на микроскопа е даден, че древните са знаели, че гледайки през извити огледала или стъклени сфери с вода, малките неща се виждат с увеличение. Тогава първите десетилетия на седемнадесети век започват да провеждат тестове с лещи, за да се получи по-голямо увеличение на предметите. За това те се основават на първия инструмент, направен с лещи, които са имали голям успех „ телескопът “, използван за първи път в астрономически цели от Галилей през 1609 година.
В началото на 20-ти век производството му е концентрирано главно в Германия и през следващите години се разработват фаза контраст, флуоресценция, холография, интерференция, рентгенови лъчи, ултравиолетова светлина, методи с електрони и протони. Компютърни микроскопи също са разработени за количествено определяне, количествено определяне и триизмерен анализ, тези инструменти отварят много полета в областта на микроскопията. От 1660 г. до наши дни оптичният микроскоп е основният стълб за изследване на невидимото. Въпреки това, разделителната му способност се увеличава с течение на времето с подобряването на качеството на лещите, както и силата на увеличение.
През 1930 г. субмикроскопичният свят се разширява със създаването на електронния микроскоп, чиято основна разлика спрямо оптичния микроскоп е увеличението на 1000 пъти повече във фазата на увеличение на наблюдавания материал, придружено от по-добра способност за разделителна способност, генерираща по-добра дефиниция и увеличение в микроскопичен свят.
Има два типа основни електронни микроскопи, и двата са изобретени едновременно, но те изпълняват различни функции, това са:
- Трансмисионен електронен микроскоп (MET): той е отговорен за прожектирането на електрони през тънък слой от материал или тъкан, които трябва да бъдат наблюдавани, отразяващи изображение на фосфоресциращ екран.
- Сканиращ електронен микроскоп (SEM): това създава изображение, което създава впечатлението, че е в три измерения. Този микроскоп използва три или две точки, където електроните на пробата пристигат, за да сканират повърхността на образеца, който трябва да се наблюдава.
Повечето от пионерите на електронната микроскопия в биологията са все още живи и най-важните са: Алберт Клод, Earnest Fullam, Don Fawcett, Charles Leblond, John Luft, Daniel Pease, Keith Porter и George Palade.
