Микроорганизмите могат да бъдат определени като вид живи същества с малки размери до степен, че те са невидими за човешкото око. Те могат да бъдат от различни видове, сред най-важните са водорасли, гъбички, бактерии и др. Има хора, които поддържат хипотезата, че някои микроорганизми са били предшественици на живота на планетата Земя, докато други малко по-сложни предположения потвърждават, че те са с извънземен произход и че по това време те са се разширили по лицето на планетата и са дали живот към всичко, което е днес. По принцип много често микроорганизмите са изградени от клетка уникален, но това не означава, че няма такива, съставени от повече от една клетка.
Водени от необходимостта да се противопоставят на болестите, изследването на микроорганизмите имаше голям импулс, поради тази причина, тъй като медицината се разви по същия начин, както познанията за тези живи същества.
Определени микроорганизми се считат за отговорни за увреждането на определени храни, което може да бъде вредно за онези индивиди, които са консумирали такива храни, причинявайки различни заболявания, въпреки че има някои микроорганизми, които могат да допринесат за различни процедури, пример за това е ферментация, при която споменатите организми се използват за приготвяне на храни като кисело мляко или сирене, т.е. има микроорганизми, които могат да променят конфигурацията на определени храни или дори да удължат живота им.
Микроорганизмите, които имат най-голямо присъствие в природата, са бактерии, които могат да бъдат намерени в различни видове местообитания, има бактерии, които могат да бъдат вредни за човешкото здраве, пример за това е " Escherichia coli ", който е отговорен за заболявания като септицемия. Въпреки това има и други бактерии, които могат да бъдат полезни за организма, пример е "Lactobacillus acidophilus", който има способността да произвежда различни вещества като витамин К и водороден прекис, които могат да бъдат от голяма помощ за организъм.
