Хипокампусът се намира в медиалния темпорален лоб на мозъка, под кортикалната повърхност. Структурата му е разделена на две половини, които се намират от лявата и дясната страна на мозъка. Органът е извит във форма, която прилича на морски кон, а името му произлиза от свързване на гръцките думи "хипопотам" за коня и "кампос" за морето.
За хипокампуса за първи път се говори от венецианския анатом Хулио Сесар Аранци през 1587 година. Той го описва като хребет по пода на темпоралния рог на страничната камера и го сравнява първо с копринена буба, а по-късно и с морски кон. През 1740-те години парижки хирург Рене-Жак Кроасан дьо Гаренжеот въвежда термина „cornu Ammonis“, което означава рогът на Амон, древен египетски бог.
Хипокампусът се грижи за формирането на дългосрочна памет и космическата навигация. При заболявания като болестта на Алцхаймер, хипокампусът е един от първите региони на мозъка, който се уврежда и това води до загуба на памет и дезориентация, свързани със състоянието.
Хипокампусът може да се повреди поради лишаване от кислород или хипоксия, инфекция или възпаление или в резултат на епилепсия на темпоралния лоб. Хората с увреждане на хипокампата развиват амнезия и може да не успеят да формират нови спомени за времето или местоположението на събитие, например.
При болестта на Алцхаймер (и други форми на деменция) хипокампусът е една от първите области на мозъка, които са повредени; Краткосрочната загуба на памет и дезориентация са сред първите симптоми. Увреждането на хипокампуса може да се дължи и на кислороден глад (хипоксия), енцефалит или епилепсия на медиалния темпорален лоб. Хората с големи двустранни увреждания на хипокампа могат да получат антероградна амнезия (неспособността да се формират и запазят нови спомени).
Тъй като различните видове невронални клетки са добре наслоени в хипокампуса, той често се използва като модел за изследване на неврофизиологията. Формата на невронна пластичност, известна като дългосрочно потенциране (LTP), е открита за първи път в хипокампуса и често е изследвана в тази структура. Смята се, че LTP е един от основните нервни механизми, чрез които спомените се съхраняват в мозъка.
