Етимологията на думата филогения идва от гръцкото "phylon", което означава племе или раса и "ген", което означава да се произвежда или генерира, това е клон на биологията, който отговаря за изучаването на произхода и развитието на видовете по начин глобален. Терминът е използван за първи път от биолога Ернст Хекел през 1866 г., тази част от биологията е ратифицирала теориите, предложени от биолозите Чарлз Дарвин и Алфред Ръсел Уолъс, според които живите същества не остават непроменени, а се развиват с течение на времето. време.
Тази наука споделя идеята, че всички живи същества имат общ предшественик и както споменахме, тя изучава връзките, които съществуват между различни организми и се опитва да установи потомците или родството, което може да съществува между единия и другия. В момента в резултат на еволюцията в областта на генетиката приликите и разликите между един и друг вид могат да бъдат изследвани по-ефективно.
През годините се споделя идеята, че живите същества се развиват поради мутации в ДНК, за да се адаптират по-добре към околната среда, в някои случаи тези мутации отстъпват място на нови видове, но в други тези ДНК модификациите променят само някои черти, които ще помогнат на вида да се адаптира към своята екосистема.
Прилагането на филогения понастоящем е постигнало голям напредък в научната и медицинската област, пример за това е изследването на митохондриалната последователност, също при откриване на произхода на заразна болест при сравняване на щамовете на бактериите и вируси.